从FFPE样本中纯化DNA和RNA。

[A] 从多个大鼠FFPE组织样本中纯化基因组DNA并储存于室温。使用AllPrep DNA/RNA FFPE Kit或QIAamp DNA FFPE Tissue Kit（专用于从FFPE样本中纯化DNA的试剂盒，作为对照）进行纯化，两种试剂盒都含有RNase消化试剂。采用吸光度测定方法检测每个20 μm组织切片的DNA产量。[B] 从多个大鼠FFPE组织样本中纯化RNA并储存于室温。使用AllPrep DNA/RNA FFPE Kit或RNeasy FFPE Tissue Kit（专用于从FFPE样本中纯化DNA的试剂盒，作为对照）进行纯化。采用吸光度测定方法检测每个10 μm组织切片的RNA产量。从FFPE组织中纯化DNA或RNA时，AllPrep Kit的表现与专用的纯化试剂盒表现相当。

对预扩增的cDNA进行芯片分析。

使用AllPrep DNA/RNA FFPE Kit从人类乳腺FFPE组织中纯化总RNA。然后使用RT2 FFPE PreAMP技术进行逆转录。使用Human Cell Cycle RT2 Profiler PCR Array，通过real-time PCR进行基因表达分析，将肿瘤样本与非肿瘤样本进行对比。ΔΔCT分析显示：肿瘤样本中的基因表达与非肿瘤样本的基因表达存在x倍的差异。

对FFPE样本中的DNA和RNA进行可靠扩增。

使用AllPrep DNA/RNA FFPE Kit或专用于从FFPE样本中纯化DNA或RNA的试剂盒（QIAamp DNA FFPE Tissue Kit 或RNeasy FFPE Kit，作为对照）从大鼠FFPE组织中纯化获得[A] DNA 和[B]、[C] RNA。在ABI PRISM 7900HT Sequence Detection System上，使用[A] QuantiTect SYBR® Green PCR Kit对78 bp的Prnp基因扩增子进行Real-time PCR分析，或是用[B]、[C] QuantiTect SYBR® Green RT-PCR Kit对Jun原癌基因表达进行real-time RT-PCR分析。AllPrep Kit和另外两个专用试剂盒的CT值相当，表明三种试剂盒纯化DNA或RNA的效率相当。[C] 此外，在没有逆转录酶（–RT）的条件下分析了Jun基因的表达。脾脏是富含DNA的组织，其扩增曲线平坦，说明纯化的RNA中不含基因组DNA。

AllPrep DNARNA FFPE样本纯化步骤。